Doctorant sous la direction de G. VALENZISE

Titre de la thèse: Fast and accurate 3D X ray image reconstruction for Non Destructive Testing industrial applications
Résumé de la thèse: 2D and 3D X-ray Computed Tomography is widely used in medical imaging as well as in Non Destructive Testing (NDT) for industrial applications. In order to reduce the X-ray dose in medical applications, and also for reducing the reconstruction time in NDT applications, we need to optimize the reconstruction methods while reducing the number of projections, thus using incomplete data to do the reconstruction. In the NDT applications, often the under-detected object is of huge size, which augments the difficulty of reconstruction. In our work we proposed to use the Bayesian Inference so that the prior information and measured data can be combined and various prior models could be applied, at the same time all the variables and parameters can be estimated directly. Mainly two methods are proposed for the piece-wise continuous image reconstruction problem. The first one reconstruct the object while enforcing sparsity of the haar transformation coefficients of object. The second method reconstruct objects while the contours are estimated simultaneously. In our work, all the proposed methods are adapted to the 3D huge data size case, while in 3D reconstruction application we uses the GPU processor to accelerate computation.

2019

Journal articles

titre
Phase IIa, placebo-controlled, randomised study of lutikizumab, an anti-interleukin-1α and anti-interleukin-1β dual variable domain immunoglobulin, in patients with erosive hand osteoarthritis
auteur
Margreet Kloppenburg, Charles Peterfy, Ida Haugen, Féline Kroon, Su Chen, Li Wang, Wei Liu, Gwen Levy, Roy Fleischmann, Francis Berenbaum, Désirée van der Heijde, Prashant Bansal, Ruth Wittoek, Sheng Feng, Yuni Fang, Mary Saltarelli, Jeroen Medema, Marc Levesque
article
Annals of the Rheumatic Diseases, BMJ Publishing Group, 2019, 78 (3), pp.413-420. ⟨10.1136/annrheumdis-2018-213336⟩
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Conference papers

titre
Enhancing HEVC Spatial Prediction by Context-based Learning
auteur
Li Wang, Attilio Fiandrotti, Andrei Purica, Giuseppe Valenzise, Marco Cagnazzo
article
ICASSP 2019 - 2019 IEEE International Conference on Acoustics, Speech and Signal Processing (ICASSP), May 2019, Brighton, France. pp.4035-4039
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2018

Journal articles

titre
Bayesian 3D X-ray Computed Tomography with a Hierarchical Prior model for Sparsity in Haar Transform domain
auteur
Li Wang, Ali Mohammad-Djafari, Nicolas Gac, Mircea Dumitru
article
Entropy, MDPI, 2018, Special Issue "Probabilistic Methods for Inverse Problems", ⟨10.3390/e20120977⟩
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titre
Computation Offloading with Data Caching Enhancement for Mobile Edge Computing
auteur
Shuai Yu, Rami Langar, Xiaoming Fu, Li Wang, Zhu Han
article
IEEE Transactions on Vehicular Technology, Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2018, 67 (11), pp.11098-11112. ⟨10.1109/TVT.2018.2869144⟩
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titre
Port-Hamiltonian modeling of non-isothermal chemical reaction networks
auteur
Li Wang, Bernhard Maschke, Arjan Schaft
article
Journal of Mathematical Chemistry, 2018, 56 (6), pp.1707-1727. ⟨10.1007/s10910-018-0882-9⟩
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Software

titre
iterTomoGPI-GPL - Ref CNRS du pré-dépôt APP 11562-02 (num IDDN prochainement disponible)
auteur
Mircea Dumitru, Li Wang, Nicolas Gac, Ali Mohammad-Djafari
article
2018
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2017

Journal articles

titre
Longitudinally Guided Super-Resolution of Neonatal Brain Magnetic Resonance Images
auteur
Yongqin Zhang, Feng Shi, Jian Cheng, Li Wang, Pew-Thian Yap, Dinggang Shen
article
IEEE Transactions on Cybernetics, IEEE, 2017, pp.1 - 13. ⟨10.1109/TCYB.2017.2786161⟩
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titre
X-ray Computed Tomography using a sparsity enforcing prior model based on Haar transformation in a Bayesian framework
auteur
Li Wang, Ali Mohammad-Djafari, Nicolas Gac
article
Fundamenta Informaticae, Polskie Towarzystwo Matematyczne, 2017, 155 (4), pp.449-480. ⟨10.3233/FI-2017-1594⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01490523/file/FI_LW_AMD_NG_revised.pdf BibTex
titre
Improving the activity and stability of Ir catalysts for PEM electrolyzer anodes by SnO 2 :Sb aerogel supports: does V addition play an active role in electrocatalysis?
auteur
Li Wang, Feihong Song, Guillaume Ozouf, Dorin Geiger, Tobias Morawietz, Michael Handl, Pawel Gazdzicki, Christian Beauger, Ute Kaiser, Renate Hiesgen, Aldo S. Gago, K. Andreas Friedrich
article
Journal of Materials Chemistry. A, Royal Society of Chemistry, 2017, 5 (7), pp.3172 - 3178. ⟨10.1039/C7TA00679A⟩
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Conference papers

titre
Comparaison des performances d’algorithmes itératifs bayésiens basés sur trois classes de modèles a priori parcimonieux appliqués à la reconstruction tomographique
auteur
Mircea Dumitru, Li Wang, Nicolas Gac, Ali Mohammad-Djafari
article
26eme Colloque GRETSI Traitement du Signal & des Images, GRETSI 2017, Sep 2017, Juans-Les-Pins, France
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01569349/file/Gretsi2017_Mircea.pdf BibTex
titre
Reconstruction 3D en tomographie à rayons X à l'aide d'un modèle a priori hiérarchique utilisant la transformation de Haar
auteur
Li Wang, Nicolas Gac, Ali Mohammad-Djafari
article
26eme Colloque GRETSI Traitement du Signal & des Images, GRETSI 2017, Sep 2017, Juan-Les-Pins, France
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01567888/file/Gretsi_LW_NG_AMD_revised.pdf BibTex
titre
Bayesian method with sparsity enforcing prior of dual-tree complex wavelet transform coefficients for X-ray CT image reconstruction
auteur
Li Wang, Ali Mohammad-Djafari, Nicolas Gac
article
25th European Signal Processing Conference (EUSIPCO 2017), Aug 2017, Kos island, Greece. ⟨10.23919/eusipco.2017.8081253 ⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01567875/file/Eusipco2017_LW_AMD_NG_Revised.pdf BibTex
titre
Model selection in the sparsity context for inverse problems in Bayesian framework
auteur
Mircea Dumitru, Li Wang, Ali Mohammad-Djafari, Nicolas Gac
article
37th International Workshop on Bayesian Inference and Maximum Entropy Methods in Science and Engineering, Jul 2017, Jarinu, Brazil
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01568318/file/Dumitru_MaxEnt2017.pdf BibTex
titre
Unsupervised sparsity enforcing iterative algorithms for 3D image reconstruction in X-ray computed tomography
auteur
Mircea Dumitru, Nicolas Gac, Li Wang, Ali Mohammad-Djafari
article
The 2017 International Conference on Fully Three-Dimensional Image Reconstruction in Radiology and Nuclear Medicine, Jun 2017, Xi'an, China. pp.359-362
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01568325/file/Fully3D2017.pdf BibTex
titre
3D X-ray Computed Tomography reconstruction using sparsity enforcing Hierarchical Model based on Haar Transformation
auteur
Li Wang, Ali Mohammad-Djafari, Nicolas Gac, Mircea Dumitru
article
The 2017 International Conference on Fully Three-Dimensional Image Reconstruction in Radiology and Nuclear Medicine, Jun 2017, Xi'an, China. pp.295-298
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01490554/file/Fully3D_LW_AMD_NG_MD.pdf BibTex
titre
X-ray computed tomography simultaneous image reconstruction and contour detection using a hierarchical markovian model
auteur
Li Wang, Ali Mohammad-Djafari, Nicolas Gac
article
The 42nd IEEE International Conference on Acoustics, Speech and Signal Processing (ICASSP 2017), Mar 2017, New Orleans, United States. pp.6070-6074, ⟨10.1109/ICASSP.2017.7953322⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01490508/file/ICASSP2017_ROCC_Wang_Final.pdf BibTex

Theses

titre
Fast and Accurate 3D X ray Image Reconstruction for Non Destructive Test Industrial Applications
auteur
Li Wang
article
Image Processing [eess.IV]. Université Paris-Saclay, 2017. English. ⟨NNT : 2017SACLS362⟩
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https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-01695872/file/75140_WANG_2017_diffusion.pdf BibTex
titre
Algorithms and Criteria for Volumetric Centroidal Voronoi Tessellations
auteur
Li Wang
article
General Mathematics [math.GM]. Université Grenoble Alpes, 2017. English. ⟨NNT : 2017GREAM002⟩
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https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-01455701/file/WANG_2017_archivage.pdf BibTex

2016

Journal articles

titre
Primary mediastinal large B-cell lymphoma: transcriptional regulation by miR-92a through FOXP1 targeting
auteur
Martha Romero, Guillaume Gapihan, Luis Jaime Castro-Vega, Andrés Acevedo, Li Wang, Zhao Wei Li, Morad El Bouchtaoui, Mélanie Di Benedetto, Philippe Ratajczak, Jean-Paul Feugeas, Catherine Thieblemont, Carlos Saavedra, Anne Janin
article
Oncotarget, Impact journals, 2016, ⟨10.18632/oncotarget.12988⟩
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https://www.hal.inserm.fr/inserm-01404979/file/Romero.pdf BibTex
titre
Computable upper and lower bounds on eigenfrequencies
auteur
Li Wang, Ludovic Chamoin, Pierre Ladevèze, Hongzhi Zhong
article
Computer Methods in Applied Mechanics and Engineering, Elsevier, 2016, 302, pp.27-43. ⟨10.1016/j.cma.2016.01.002⟩
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BibTex
titre
A Hierarchical Approach for Regular Centroidal Voronoi Tessellations
auteur
Li Wang, Franck Hétroy-Wheeler, Edmond Boyer
article
Computer Graphics Forum, Wiley, 2016, 35 (1), pp.152-165. ⟨10.1111/cgf.12716⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01185210/file/wang-CGF2015-HierarchicalRegularCVT.pdf BibTex
titre
The S1-S2 linker determines the distinct pH sensitivity between ZmK2.1 and KAT1
auteur
Li Wang, Shun-Ying Yang, Man-Yuan Guo, Ya-Nan Huang, Herve Sentenac, Anne-Aliénor Véry, Yan-Hua Su
article
Plant Journal, Wiley, 2016, 85 (5), pp.675-685. ⟨10.1111/tpj.13134⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01595657/file/WangL.-et%20al-PlantJ.-2016_%7B80175B22-C25E-4851-B500-1EB529273701%7D.pdf BibTex

Conference papers

titre
On Volumetric Shape Reconstruction from Implicit Forms
auteur
Li Wang, Franck Hétroy-Wheeler, Edmond Boyer
article
ECCV 2016 - European Conference on Computer Vision, Oct 2016, Amsterdam, Netherlands. ⟨10.1007/978-3-319-46487-9_11⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01349059/file/OnVolumetric%20ShapeReconstructionfromImplicitForms.pdf BibTex
titre
A Student-t based sparsity enforcing hierarchical prior for linear inverse problems and its efficient Bayesian computation for 2D and 3D Computed Tomography
auteur
Ali Mohammad-Djafari, Li Wang, Nicolas Gac, Folkert Bleichrodt
article
International traveling workshop on interactions between sparse models and technology, Aug 2016, AALBORG, Denmark
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01403787/file/itwist.pdf BibTex
titre
Bayesian X-ray Computed Tomography using a Three-level Hierarchical Prior Model
auteur
Li Wang, Ali Mohammad-Djafari, Nicolas Gac
article
AIP Conference, Bayesian inference and maximum entropy methods in science and engineering (Maxent 2016), Jul 2016, Gent, Belgium. ⟨10.1063/1.4985361 ⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01403790/file/Paper_MaxEnt2016_LiWang_revised2.pdf BibTex
titre
Computed tomography reconstruction based on a hierarchical model and variational Bayesian method
auteur
Li Wang, Ali Mohammad-Djafari, Nicolas Gac, Mircea Dumitru
article
IEEE International Conference on Acoustics, Speech and Signal Processing (ICASSP), Mar 2016, Shanghai, China. pp.883-887, ⟨10.1109/ICASSP.2016.7471802⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01403784/file/ICASSP_Wang_Final.pdf BibTex
titre
Irreversible port-Hamiltonian Approach to Modeling and Analyzing of Non-isothermal Chemical Reaction Networks
auteur
Li Wang, Bernhard Maschke, Arjan Schaft
article
IFAC-PapersOnLine - FOSBE, 2016, Magdeburg, Germany. pp.134-139, ⟨10.1016/j.ifacol.2016.12.115⟩
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Reports

titre
Shape Animation with Combined Captured and Simulated Dynamics
auteur
Benjamin Allain, Li Wang, Jean-Sébastien Franco, Franck Hetroy-Wheeler, Edmond Boyer
article
[Research Report] arXiv:1601.01232, ArXiv. 2016, pp.11
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https://hal.inria.fr/hal-01255337/file/augmentedanimation.pdf BibTex

2015

Journal articles

titre
Dynamics and Cell-Type Specificity of the DNA Double-Strand Break Repair Protein RecN in the Developmental Cyanobacterium Anabaena sp. Strain PCC 7120
auteur
Sheng Hu, Jinglan Wang, Li Wang, Cheng-Cai Zhang, Wen-Li Chen
article
PLoS ONE, Public Library of Science, 2015, 10 (e0139362), ⟨10.1371/journal.pone.0139362⟩
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https://hal-amu.archives-ouvertes.fr/hal-01235678/file/fetchObject.pdf BibTex
titre
LRTV: MR Image Super-Resolution with Low-Rank and Total Variation Regularizations
auteur
Feng Shi, Jian Cheng, Li Wang, Pew-Thian Yap, Dinggang Shen
article
IEEE Transactions on Medical Imaging, Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2015, pp.8
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01154770/file/LRTV_TMI.pdf BibTex

Conference papers

titre
Super-Resolution Reconstruction of Diffusion-Weighted Images Using 4D Low-Rank and Total Variation
auteur
Feng Shi, Jian Cheng, Li Wang, Pew-Thian Yap, Dinggang Shen
article
Computational Diffusion MRI, Oct 2015, Munich, Germany. ⟨10.1007/978-3-319-28588-7_2⟩
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BibTex
titre
Verification for eigenvalue problems
auteur
Li Wang, Ludovic Chamoin, Pierre Ladevèze
article
7th International Conference on Adaptive Modeling and Simulation - ADMOS 2015, Jun 2015, Nantes, France
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BibTex
titre
Stabilization of Control Contact Systems
auteur
Li Wang, Bernhard Maschke, A.J. Schaft
article
Proceedings of the 5th IFAC Workshop on Lagrangian and Hamiltonian Methods for Nonlinear Control, 2015, Lyon, France. pp.144-149, ⟨10.1016/j.ifacol.2015.10.229⟩
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2014

Journal articles

titre
Microfluidic device with integrated microfilter of conical-shaped holes for high efficiency and high purity capture of circulating tumor cells
auteur
Yadong Tang, Jian Shi, Sisi Li, Li Wang, Yvon E. Cayre, Yong Chen
article
Scientific Reports, Nature Publishing Group, 2014, 4, pp.6052. ⟨10.1038/srep06052⟩
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https://hal.sorbonne-universite.fr/hal-01358813/file/srep06052.pdf BibTex
titre
The regulation of HanA during heterocyst development in cyanobacterium Anabaena sp PCC 7120
auteur
Jing-Jing Lu, Lei Shi, Wen-Li Chen, Li Wang
article
World Journal of Microbiology and Biotechnology, Springer Verlag, 2014, 30 (10), pp.2673-2680. ⟨10.1007/s11274-014-1691-3⟩
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Conference papers

titre
Joint estimation of head pose and visual focus of attention.
auteur
Yingning Huang, Dingrui Duan, Jinshi Cui, Franck Davoine, Li Wang, Hongbin Zha
article
IEEE International Conference on Image Processing, Oct 2014, Paris, France. ⟨10.1109/ICIP.2014.7025674⟩
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BibTex
titre
Longitudinal guided super-resolution reconstruction of neonatal brain MR images
auteur
Feng Shi, Jian Cheng, Li Wang, Pew-Thian Yap, Dinggang Shen
article
International Workshop on Spatio-temporal Image Analysis for Longitudinal and Time-Series Image Data, Oct 2014, Boston, United States. ⟨10.1007/978-3-319-14905-9_6⟩
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BibTex
titre
Bayesian 3D X-ray computed tomography image reconstruction with a scaled Gaussian mixture prior model
auteur
Li Wang, Nicolas Gac, Ali Mohammad-Djafari
article
34th International Workshop on Bayesian Inference and Maximun Entropy Methods in Science and Engineering (MaxEnt'14), Sep 2014, Amboise, France. pp.556-563, ⟨10.1063/1.4906022⟩
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https://hal-centralesupelec.archives-ouvertes.fr/hal-01338706/file/54_paper.pdf BibTex
titre
Efficiency Evaluation of Agricultural Informatization Based on CCR and Super-Efficiency DEA Model
auteur
Xu Han, Li Wang, Hui Wang, Shuqin Wang
article
8th International Conference on Computer and Computing Technologies in Agriculture (CCTA), Sep 2014, Beijing, China. pp.240-246, ⟨10.1007/978-3-319-19620-6_30⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01420239/file/978-3-319-19620-6_30_Chapter.pdf BibTex

2013

Journal articles

titre
Differential regulation of sunitinib targets predicts its tumor-type-specific effect on endothelial and/or tumor cell apoptosis
auteur
Guilhem Bousquet, Mariana Varna, Irmine Ferreira, Li Wang, Pierre Mongiat-Artus, Christophe Leboeuf, Cédric Bazelaire, Sandrine Faivre, Philippe Bertheau, Eric Raymond, Stéphane Germain, Anne Janin
article
Cancer Chemotherapy and Pharmacology, Springer Verlag, 2013, 72 (6), pp.1183--1193. ⟨10.1007/s00280-013-2300-0⟩
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Conference papers

titre
Low-Rank Total Variation for Image Super-Resolution
auteur
Feng Shi, Jian Cheng, Li Wang, Pew-Thian Yap, Dinggang Shen
article
Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention – MICCAI 2013, Oct 2013, Berlin, Germany. ⟨10.1007/978-3-642-40811-3_20⟩
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BibTex
titre
Webpage Designs for Diverse Cultures: An Exploratory Study of User Preferences in China
auteur
Yin Su, David Liu, Xiaomeng Yuan, Justin Ting, Jingguo Jiang, Li Wang, Lin Gao
article
14th International Conference on Human-Computer Interaction (INTERACT), Sep 2013, Cape Town, South Africa. pp.339-346, ⟨10.1007/978-3-642-40483-2_24⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01497446/file/978-3-642-40483-2_24_Chapter.pdf BibTex

2012

Journal articles

titre
BCL2 expression in CD105 positive neoangiogenic cells and tumor progression in angioimmunoblastic T-cell lymphoma.
auteur
Philippe Ratajczak, Christophe Leboeuf, Li Wang, Josette Brière, Irmine Loisel-Ferreira, Catherine Thiéblemont, Wei-Li Zhao, Anne Janin
article
Modern Pathology, Nature Publishing Group: Open Access Hybrid Model Option B, 2012, 25 (6), pp.805-14. ⟨10.1038/modpathol.2012.1⟩
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https://www.hal.inserm.fr/inserm-00682931/file/Ratajczak-submitted_revised_-Modern_Pathology.pdf https://www.hal.inserm.fr/inserm-00682931/file/inserm-00682931_edited.pdf BibTex

Conference papers

titre
Urban Wetland Change Detection Using Time-Series Remote Sensing Data
auteur
Lin Liu, Yapeng Zhou, Li Wang, Jianchun Hou, Mingquan Wu
article
6th Computer and Computing Technologies in Agriculture (CCTA), Oct 2012, Zhangjiajie, China. pp.177-186, ⟨10.1007/978-3-642-36137-1_22⟩
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https://hal.inria.fr/hal-01348230/file/978-3-642-36137-1_22_Chapter.pdf BibTex

2011

Journal articles

titre
Patterning cells and shear flow conditions: convenient observation of endothelial cell remoulding, enhanced production of angiogenesis factors and drug response.
auteur
Li Wang, Zhi-Ling Zhang, Joanna Wdzieczak-Bakala, Dai-Wen Pang, Jianmiao Liu, Yong Chen
article
Lab on a Chip, Royal Society of Chemistry, 2011, 11 (24), pp.4235-40. ⟨10.1039/c1lc20722a⟩
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titre
Bevacizumab potentiates chemotherapeutic effect on T-leukemia/lymphoma cells by direct action on tumor endothelial cells.
auteur
Li Wang, Wen-Yu Shi, Fan Yang, Wei Tang, Guillaume Gapihan, Mariana Varna, Zhi-Xiang Shen, Sai-Juan Chen, Christophe Leboeuf, Anne Janin, Wei-Li Zhao
article
Haematologica, Ferrata Storti Foundation, 2011, 96 (6), pp.927-31. ⟨10.3324/haematol.2010.037689⟩
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https://www.hal.inserm.fr/inserm-00741102/file/927.full_1_.pdf BibTex

2010

Journal articles

titre
Cytostatic and anti-angiogenic effects of temsirolimus in refractory mantle cell lymphoma.
auteur
Li Wang, Wen-Yu Shi, Zhi-Yuan Wu, Mariana Varna, Ai-Hua Wang, Li Zhou, Li Chen, Zhi-Xiang Shen, He Lu, Wei-Li Zhao, Anne Janin
article
Journal of Hematology and Oncology, BioMed Central, 2010, 3 (1), pp.30. ⟨10.1186/1756-8722-3-30⟩
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https://www.hal.inserm.fr/inserm-00668207/file/1756-8722-3-30.pdf BibTex

2008

Conference papers

titre
Simulation of Migration effects in PoP
auteur
Kirsten Weide-Zaage, Hélène Fremont, Li Wang
article
EuroSimE (2008), Apr 2008, Germany. pp.EuroSimE (2008)
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